Les traitements médicamenteux sont nombreux, efficaces à court terme mais ils ne traitent pas la maladie. On retrouve la classe des antiacides, des antagonistes H2 et des IPP. Ils peuvent cependant poser des problèmes s'ils sont pris à long terme: fractures dues à une baisse de l'absorption du calcium, anémie car carence en vit. B12 et fer, infection digestive, carence en magnésium, insuffisance rénale chronique, cancer de l'estomac?
Dans tous les cas, un arrêt brutal du traitement n'est pas conseillé car il y a un effet de rebond (acidité très importante pendant environ 15 jours après le sevrage). Il faut donc diminuer progressivement le traitement lorsqu'il est quotidien.
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